Juuni algus tuleb suviselt soe, hiljem läheb jahedamaks
Juunikuu esimesel kümnel päeval määrab Eesti ilma Venemaal oleva kõrgrõhuala lääneserv, mida mööda saabub meile lõunast väga soe ja niiske õhumass, kus kümnepäevaku lõpul arenevad hoovihma- ja äikesepilved ning õhutemperatuuri maksimumid tõusevad sisemaal kohati üle 30°C.
Pärast 10. juunit Venemaa kõrgrõhuala mõju väheneb ja väga soe õhk taandub aeglaselt itta. Jaanikuu keskpaiku on põhja poolt oodata paariks päevaks jahedamat õhumassi, seejärel taastub aga juunile tavapärane läänevool. Ilm on mõõdukalt soe ja aeg-ajalt sajab vihma.
Kuu keskmine õhutemperatuur tuleb keskmisest ehk 13,1-15,5 kraadist kõrgem. Sademeid on aga keskmise piires, mis tähendab, et kuine sajuhulk jääb 47-87 millimeetri piiresse. Kogu juunikuu vältel sajab aeg-ajalt hoovihma ja on äikest, kuid sajusummad on piirkonniti väga erinevad. Kuivem on aga kuu esimene pool.